Ayant terminé ses études de pilote à l’académie spatiale de Belda, Ayato rentre chez lui pour retrouver sa famille sur la planète Analis.
Pour arriver rapidement, il embarque sur un vaisseau cargo piloté par deux baroudeurs de l’espace : Ryû et Siman, l’homme singe.
En chemin, ils croisent un immense vaisseau que l’on nomme le Cosmosaure et qui se dirige lui aussi vers Analis. En arrivant près de la planète, Ayato, Ryû et Siman assistent avec impuissance à la destruction des forces spatiales de la planète Analis.
Ryu décide de faire demi-tour et de rejoindre la planète Sheita, mais Ayato l’oblige, en le menaçant, de le déposer sur sa planète. Ryu apprend qu’Ayato est le fils d’une de ses connaissances sur Analis.
De leur côté, les Stressos interceptent un message de détresse provenant d’un village d’Analis en direction de la Terre. Le Général Koménor préférant ne pas affronter les armées Terriennes envoi le Commandant Volcor sur place pour trouver l’origine du SOS et détruire le Gyro-émetteur.
Après avoir déposé Ayato sur Analis, Ryû et Siman décident de repartir au plus vite vers Sheita.
Pendant ce temps, les Stressos découvrent que les SOS proviennent d’une habitation. Volcor et ses soldats investissent les lieux et massacrent les occupants sans trouver le Gyro-émetteur.
Ayato arrivera trop tard pour sauver sa famille et découvre les corps de son père, sa mère et de sa petite sœur. Dans un dernier râle, son père lui souffle « Gem est le fantôme ».
Mais Ayato n’a pas le temps de comprendre ces mots car les Stressos sont toujours dans la maison, il s’enfuit in-extremis par un passage secret et active l’autodestruction de la maison.
Toutefois, Ayato et rattrapé et capturé par les Stressos. Le Commandant Volcor décide de procéder à son exécution, mais il est sauvé par l’intervention de Ryû qui à finalement choisi de rester sur Analis. Après avoir mis en fuite les Stressos, ils décident de quitter la planète pour se mettre à l’abri.
Ayato apprend que Ryû connaissait très bien le vieux Gem, son père. Mais à peine sont-ils dans l’espace que leur vaisseau cargo est attaqué par les Lazerolabes. Alors que le cargo est en feu, Ayato oblige Ryû et Siman à s’éjecter par les capsules de survie et prend les commandes du vaisseau qui explose en vole. Les Stressos persuadés d’avoir tué les occupants, quittent le champ de bataille.
Soudain surgît de nulle part un vaisseau spatial en forme de bateau à trois mats. Ayato se réveille face une belle et étrange jeune femme qui se prénomme Eolia, cette dernière lui a sauvé la vie en le téléportant juste avant l’explosion.
Eolia explique à Ayato que les Stressos sont un peuple nomade dirigé par un tyran qui souhaite devenir le maître de l’univers en asservissant les planètes. Eolia indique à Ayato qu’il a un destin à accomplir et qu’il doit combattre ces envahisseurs, pour ce faire elle lui offre un fabuleux vaisseau : le San Ku Kaï.
Ayato accepte la mission confiée par Eolia et en profiter pour venger la mort de sa famille.