Quand un chirurgien décide de sauver la vie d'un enfant au détriment d'une personnalité, il ne se rend pas compte qu'il paiera très cher son geste plus tard en ayant laissé vivre un monstre en gestation.
De nos jours, en Allemagne.
Le docteur Kenzo Tenma, chirurgien japonais, exerce à l'hôpital de Dusseldorf. Pris sous son aile par le directeur, il est promis à un brillant avenir.
Pourtant, un nuit, il est appelé pour s'occuper d'un jeune garçon, grièvement blessé à la tête. Mais au cours de l'opération, on lui demander de céder sa plcae à un confrère pour aller s'occuper d'une personnalité importante ; il refuse.
Si l'enfant est sauvé, l'homme décède sur la table d'opération. C'est la fin de ses ambitions.
Mais ce n'est que quelques années plus tard, qu'il réalise la portée de son geste : le jeune garçon a donné naissance à un tueur sans âme et à l'intelligence redoutable.
Tenma décide alors de partir à la poursuite de Johann pour réparer sa faute.
Il n'imagine pas alors les remous que vont occasionner sa quête qui le plonge dans le passé trouble d'une Allemagne d'après-guerre...